Deep brain stimulation on eri teknologiaa kuin TMS. DBS:ssa asennetaan elektrodi suoraan aivoihin ja sitä kautta annetaan sähköä suoraan aivoalueelle ja päästään syvemmälle kuin TMS:llä.
TMS:n “iskusyvyys” on yleensä joitain senttejä (googlailulla nexstimin laitteella 3-4cm. Tästä ei absoluuttista varmuutta.) mutta hoito ei ole invasiivista kuten DBS.